水环境质量保持良好。福建全省12条主要水系水域功能达标率为95.9％，Ⅰ类～Ⅲ类水质所占比例为93.8％。其中，九龙江水质有所改善，水域功能达标率为91.7％，较上年提高了4.0个百分点；Ⅰ类～Ⅲ类水质比例均为90.8％，较上年提高了3.1个百分点。福建全省城市内河水域功能达标率为66.7％，较上年提高了7.2个百分点。
大气环境方面，去年福建全省城市环境空气质量保持优良水平。酸雨污染强度较上年略有减轻。根据福建全省9个设区城市空气污染指数（API）年平均值范围为51－69，优、良天数比例为97.5％，较上年提高了1.4个百分点，高于全国113个环保重点城市平均值6.0个百分点。
森林覆盖率继续位居全国首位，生态环境状况指数继续保持全国前列。2009年，福建全省森林面积766.65万公顷，森林覆盖率为63.10％。福建全省67个县市的生态环境质量均为良以上，其中51个县市生态环境质量为优。
福建全省公共财政对环保投入增速明显高于经济增长速度。2009年，福建全省安排地方债券约13亿元、争取中央资金4.85亿元、省级资金2.15亿元，全部用于污水管网建设。省财政厅、环保厅联合下发重点流域整治专项资金管理办法和资金投向，将闽江、九龙江、敖江流域整治专项资金由原来的每年5000万元、2800万元、500万元分别提高到1亿元、9000万元和1500万元。（记者 潘园园）
